Mina Padi

I.       PENDAHULUAN

1.1.  Latar Belakang

Dalam rangka menunjang visi Kementerian Kelautan dan Perikanan (KKP) menjadikan Indonesia sebagai penghasil ikan terbesar tahun 2015 yang tentunnya dikaitkan dengan program kegiatan ketahanan pangan tentunya kita melihat potensi sumber daya yang kita miliki. Diantara potensi yang terbesar yang dimiliki dalam rangka peningkatan produksi tersebut adalah lahan sawah yang selama ini sudah tertata dan memiliki manajemen usaha yang sudah relatif bagus tapi belum dimanfaatkan.

Budidaya minapadi adalah budidaya terpadu yang dapat meningkatkan produktivitas lahan sawah, yaitu selain tidak mengurangi hasil padi, juga dapat menghasilkan ikan. Lahan sawah menjadi subur dengan adanya kotoran ikan yang mengandung berbagai unsur hara, sehingga dapat mengurangi penggunaan pupuk. Ikan dapat juga membatasi tumbuhnya tanaman lain yang bersifat kompetitor dengan padi dalam pemanfaatan unsur hara, sehingga dapat juga mengurangi biaya penyiangan tanaman liar.

Budidaya minapadi dilakukan dalam 2 (dua) pola tanam, yaitu penyelang dan tumpang sari. Pola tanam penyelang adalah pemeliharaan ikan di sawah menjelang penanaman padi, sambil menunggu hasil semaian padi untuk dapat ditanam. Pola tumpang sari adalah pemeliharaan ikan/udang bersama padi pada satu hamparan sawah.

Dalam upaya meningkatkan pendapatan pembudidaya ikan yang juga sebagai petani padi, dalam budidaya padi harus digunakan jenis padi unggul yang sesuai dengan kondisi sawah dan pemilihan jenis ikan unggul yang mempunyai daya serap dan nilai ekonomis tinggi.

Minapadi telah lama dikembangkan di Indonesia, selain menyediakan pangan sumber karbohidrat teknologi ini juga menyediakan protein sehingga cukup baik untuk meningkatkan mutu makan penduduk di pedesaan. Dengan teknologi minapadi yang tepat, minapadi dapat memberikan pendapatan yang tinggi. Keuntungan yang di dapat dari usahatani minapadi berupa produksi padi dan ikan.

1.2.  Rumusan Masala

Adapun rumusan masalah dari tulisan ini adalah sebagai berikut:

1.      Apa itu minapadi ?

2.      Bagaimanakah budidaya minapadi ?

3.      Apa keuntungan dan kelemahan budidaya minapadi ?

1.3.  Tujuan

Adapun tujuan dari tulisan ini adalah sebagai berikut :

1.      Untuk mengetahui pengertian minapadi.

2.      Untuk mengetahui budidaya minapadi

3.      Untuk mengetahui keuntungan dan kelemahan budidaya minapadi.

II.    PEMBAHASAN

2.1.  Defenisi Minapadi

Minapadi adalah cara yang digunakan oleh petani dengan menggabungkan teknik budidaya padi dan pemeliharaan ikan, yang dilakukan secara bersamaan di lahan sawah. Biasanya sistem minapadi dilakukan di sistem pengairan sawah teknik dan setengah teknis. Sebab keberadaan air di sawah dalam sistem minapadi sangan dibutuhkan. Minapadi merupakan salah satu strategi yang baru dilakukan petani, dari sistem monokultur ke sistem diversivikasi pertanian. Gerakan usaha budidaya minapdi merupakan usaha terpadu yang dapat meningkatkan produktivitas lahan sawah, dalam rangka meningkatkan pemdapatan untuk kesejahteraan petani dan terciptanya ketahanan pangan (Anonim, 2012).

2.2.  Budidaya Minapadi

Menurut Aswar (2012), terdapat 2(tiga) jenis budidaya ikan di sawah yaitu budidaya ikan sebagai penyelang tanaman padi dan budidaya secara tumpangsari atau budidaya ikan bersama padi.

a.        Budidaya Ikan Sebagai Penyelang Tanaman Padi

Pemeliharaan ikan sebagai penyelang dilakukan setelah tanah sawah dikerjakan sambil menunggu penanaman padi. Lamanya pemeliharaan biasanya 20 – 30 hari, sampai pada saat benih padi siap untuk ditanam. Pada sistem ini biasanya hanya dilakukan untuk pendederan benih ikan. Tujuannya adalah setelah umur 20 – 30 hari, hasil dederan berubah menjdai anak ikan yang siap ditebarkan di kolam.

Menurut Kementerian Kelautan dan Perikanan (2011), budidaya minapadi dengan penyelang dapat dilakukan sebagai berikut:

1.        Persiapan lahan

-          Membabat jerami sampai pangkalnya dan dibenamkan

-          Perbaikan pematang untuk mencegah kebocoran air.

-          Saluran pemasukan dan pengeluaran terletak pada sisi yang berseberangan dilengkapi dengan saringan yang terbuat dari kawat, bambu atau saringan.

-          Pengolahan dan pembalikan tanah menggunkan luku atau retovator (traktor).

-          Pembuatan careng keliling dengan lebar 40 – 100 cm dan careng penampunga (kobakan panen) dengan ukuran 1 x 2 m dan kedalaman 50 – 75 cm.

2.        Pemupukan 

-          Pemupukan dengan SP-36 dan urea tahap I sebanyak 6 – 7 gram/m² dilakukan setelah persiapan lahan atau 4 – 5 hari sebelum penebaran benih.

-          Pupuk organik diberiakn setelah petakan digenangi air setinggi 15 cm dengan frekuensi 1 - 2 pekan sekali sebanyak 30 – 100 gram/m².

3.        Pemeliharaan

-          Benih ikan yang ditebar sebanyak 30.000 ekor/ha/MT berukuran 1 – 3 cm

-          Pakan tambahan untuk ikan berupa dedak halus sebanyak 4 % dari bobot total ikan, dengan frekuensi 3 kali sehari.

-          Ketinggian air di dalam petakan selama masa pemeliharaan adalah 30 – 40 cm

-          Balikkan tumpukan jerami 3 (tiga) hari sekali untuk mempercepat proses pembusukan dan pertumbuhan pakan alami.

-          Suplai air terus – menerus dengan kecepatan 2 – 4 liter/detik untuk petakan seluas 500 m².

4.        Pemanenan.

-          Panen dilakukan 2 – 3 hari sebelum tanam padi.

-          Pengeringan petakan secara total dan dipasang saringan pada pipa pengeluaran untuk mencegah lolosnya benih.

-          Setelah masa pemeliharaan selama 30 hari dihasilkan benih ikan berukuran 3 – 5 cm sebanyak 21.000 ekor setara dengan 105 kg/ha.

b.        Budidaya Ikan Bersama Padi

Budidaya ikan bersama padi merupakan pemeliharaan ikan di sawah yang dilakukan bersama dengan tanaman padi. Lama pemeliharaan adalah sejak benih padi ditanam sampai penyiangan I, penyiangan II atau sampai tanaman padi mulai berbunga, kira-kira umur tanaman padi 50 hari. Sistem budidaya minapasi ini sering disebut sebagai sistem tumpangsari.

Menurut Kementerian Kelautan dan Perikanan (2011), budidaya minapadi dengan sistem tumpangsari dapat dilakukan sebagai berikut:

1.        Persiapan Lahan.

-          Sawah dipersiapkan sesuai dengan kebutuhan penanaman padi dan pemeliharaan ikan

-          Tanah diolah atau dibajak samapai lumpur mencapai 15 – 30 cm, de3ngan perbandingan lumpur dan air, 1:1

-          Pembuatan parit/caren untk udang galah berukuran lebar 1 m dengan kedalaman 60 – 75 cm

-          Penanaman padi

2.        Pemupukan Padi

Pada pemupukan dasar, pupuk ditaburkan secara merata pada keadaan sawah masih melumpur. Urea dan SP-36 tidak dianjurkan untuk dicampurkan pada saat penaburan. Pada pemupukan susulan, air dalam petakan diusahakan dalam keadaan macak-macak sebelum penebaran (ikan berada pada kemalir auat diungsikan terlebih dahulu). Pupuk ditaburkan diantara barisn tanaman atau ditebar secara merata. Benamkan pupuk dengan landak sambil menyiang atau diinjak-injak khusus agar bisa terbenam pada kedalaman lebih dari 3 cm.

3.        Penebaran ikan

Padat penebaran dan ukuran benih ikan disesuaikan dengan tujuan penanaman penanman, penebaran, pertama benih berukuran 1 – 3 cm (fingerking) dengan padat penebaran 3 – 5 cm ekor/m² dilakukan 3 – 5 cm setelah tanam padi. Jika benih ikan yang ditebar berukurang kurang dari 5 cm, gunakan panglojo (ikan pembimbing), yang ukurannya lebih besar (50 -75 gram) sebanyak 200-150 ekor/ha. Karena ikan ini dapat membolak balikan lumpur sehingga dapat membantu ikan-ikan kecil mencari makan. Ikan dapat diganti dengan dengan udang galah berukuran 5 – 8 gram/ekorsebanyak 2 ekor/m².  Jadwal tanam ikan pada budidaya minapadi sesuai dengan ukuran ikan dan lama pemeliharaan.

4.        Pemeliharaan

-          Apabila pertumbuhan padi tidak normal (anakan kurang) turunkan permukaan air sampai 5 cm selama 2 – 4 hari guna memberi kesempatan padi untuk bertunas.

-          Ikan perlu diberi pakan tambahan berupa dedak dengan takaran 4 – 5 % dari berat badan ikan. Untuk pakan udang galah diberikan pekan berupa pellet (protein 30 %) sebnayak 1 % dari berat badan udang/hari  dengan frekuensi 3 kali sehari.

-          Selama masa pemeliharaan kedalaman air di pelataran 10 – 15 cm dan parit 30 – 40 cm.

-          Pemasukan dan pengeluaran air dilakukan berdasarkan grafitasi.

-          Lemanya pemeliharaan ikan tergantung pada ukuran benih dan besarnya iakn yang hendak dipanen. Lama pemeliharaan benih dari ukuran kebul sampai ukuran belo 15 – 20 hari, dari belo sampai ngaramo 20 – 30 hari, dan dari ngaramo menjadi ikan konsumsi 40 – 55 hari.

5.        Pemanenan ikan

-          Pemanenan ikan sebaiknya dilakukan pada pagi hari atau sore hari pada saat suhu udara rendah.

-          Pengeringan petakan pada waktu panen harus dilakukan perlahan – lahan agar ikan dapat mencapai parit.

-          Keluarkan air pada bagian kemalir agar ikan berkumpul pada kemalir tersebut samai ketinggian air mencapai 3 – 5 cm.

-          Air yang terkumpul ditangkap dan ditampung dalam hapa yang ditempatkan pada air mengalir. Setelah petakan kering, air dapat dialiran kembali agar ikan yang masih tersisa dalam petakan dapat terselamatkan

-          Setelah masa pemeliharaan selama 90 hari dihasilkan udang ukuran konsumsi (25 – 35 g/ekor) sebanyak 15.000 – 16.000 ekor setara dengan 450 kg.

c.         Pengendalian Hama Padi dan Ikan

Untuk mengantisipasi serangan hama padi pada daerah-daerah endemik, dapat digunakan pestisida alami seperti saponim (terdapat dalam biji teh), retenone (terdapat dalam akar tumbuhan) dan nikotine (terdapat dalam daun tembakau) yang diberikan bersamaan dengan pemupukan dasar. Jenis pestisida seperti Boss 250 EC, Dyvon 95 SP dan Fish free juga dapat digunakan pada budidaya minapadi.

Penyemprotan dilakukan 1- 2 hari seblum penbaran baenih pada pagi atau sore hari dan air dallam petakan sawah setinggi 30 – 40 cm, penyemprotan ulang dilakuakan seminggu sekali selama masa pemeliharaan.

Hama ikan terdiri dari ulat, belut, ikan gabus, ikan biawak (sero), burumg kuntul, dan kuang-kuang. Untuk mengendalikan hama ulat digunakan bubu perangkap.

2.3.  Keuntungan dan Kelemahan Minapadi

Menurut Efendi (2013), minapadi memiliki beberapa keuntungan yaitu sebagai berikut:

-          Meningkatkan pendapatan petani sawah yang mengalami kegagalan panen akibat serangan hama wereng yang meningkat akibat perubahan iklim. Karena dengan adanya ikan di sawah akan mengonsumsi hama wereng yang jatuh ke air akibat gerakan ikan.

-          Meningkatkan  produksi padi yaitu sekitar 10-20% dengan pola minapadi dan sekaligus peningkatan produksi ikan minimal 1 ton/ha permusim tanam.

-          Membantu percepatan perbaikan lingkungan karena dengan pola minapadi akan mengurangi gas metan yang dibuang dari sisa pemupukan.

-          Penghematan pengeluaran pemerintah untuk subsidi pupuk karena dengan minapadi bisa mengurangi penggunaan pupuk 20 – 30 %.

-          Peningkatan konsumsi ikan guna perbaikan gizi keluarga karena dari data konsumsi ikan terlihat pada provinsi utama penghasil beras jumlah konsumsi ikan perkapita yang terendah (18 – 23 Kg/kapita sedangkan rata-rata nasional 30 kg/kapita).

-          Pengembangan industri pedesaan selain adanya penggilingan padi juga diharapkan tumbuh industri pengelolaan ikan pedesaan.

-          Diperoleh dua macam produksi sekaligus, sehingga dapat meningkatkan pendapatan keluarga.

-          Petani menjadi lebih rajin mengawasi sawahnya karena di tuntut setiap hari harus mengecek aliran air yang masuk ke sawahnya dan pengecekan saringan/filter yang ada agar ikan di sawah tidak gampang terlepas.

-          Kotoran ikan merupakan pupuk organik bagi tanaman padi.

-          Memperbaiki struktur tanah, karena ikan dalam mencari makan selalu membolak-balikan lumpur.

-          Ikan akan membantu memakan binatang-binatang kecil yang merupakan hama tanaman padi.

-          Mengurangi ketergantungan terhadap impor daging  karena ikan dapat kita produksi dengn harga yang lebih murah dibandingkan daging.

-          Ketahanan pangan yang selama ini disangga oleh beras akan dapat dikurangi dan sekaligus kelebihan beras yang dihasilkan akan dapat mengisi kebutuhan pangan dunia.

-          Meningkatkan potensi lahan sawah yang ada.

-          Meningkatkan keragaman hasil sawah selain bisa menghasilkan padi organik juga bisa menghasilkan ikan.

-          Meningkatkan pendapatan karena double usaha padi dan ikan.

-          Panen padi dengan kualitas yang bagus dan bisa organik karena bisa meminimalisir penggunaan obat-obatan kimia dan kotoran ikan bisa menjadi pupuk organik.

-          Panen ikan dengan menghemat biaya pakan karena ikan bisa memakan Azolla dan lumut yang ada disawah sebagai pakan tambahannya.

-          Meningkatkan produlsi ikan dengan luas kolam dan ketinggian airnya.

-          Membantu mengurangi serangan hama dan penya.

-          Bisa memelihara ikan sesuai umur padi diperoleh ikan siap konsumsi pada saat panen.

2.4.  Kelemahan Minapadi

Menurut Anwar (2012),  kelemahan dari sistem minapadi adalah pemberian pestisida yang berlebihan pada padi, juga dapat mempengaruhi kehidupn ikan dan mudahnya hama seperti ular, kodok, dan burung masuk kedalam sawah.

III. PENUTUP

3.1.  Kesimpulan

Berdasarkan pembahasan sebelumnya dapat disimpulkan sebagai berikut:

1.      Minapadi adalah cara yang digunakan oleh petani dengan menggabungkan teknik budidaya padi dan pemeliharaan ikan, yang dilakukan secara bersamaan di lahan sawah.

2.      Budidaya minapadi terdapat 2 (tiga) jenis yaitu budidaya ikan sebagai penyelang tanaman padi dan budidaya secara tumpangsari atau budidaya ikan bersama padi.

3.      Budidaya minapadi lebih banyak memberikan keuntungan daripada kelemahan.

3.2.  Saran

Budidaya minapadi merupakan salah satu sistem budidaya terpadu antara tanaman padi dengan ikan yang memiliki banyak keuntungan oleh karena itu sebaiknya budidaya minapadi lebih dikembankan lagi.

DAFTAR PUSTAKA

Anonim, 2012. “Mengenal Minapadi”. Diakses dari halaman website: http://ceritanurmanadi.wordpress.com/2012/10/22/mengenal-mina-padi. Pada tanggal Selasa, 24 Desember 2013. Makassar.

Aswar, 2012. Budidaya Ikan Sistem Minapadi”. Diakses dari halaman website: http://aswarpunyainfo.blogspot.com/2012/10/budidaya-ikan-sistem-mina-padi.html. Pada tanggal Selasa, 24 Desember 2013. Makassar.

Efendi, Mahmud, 2013. “Minapadi Kolam Dalam” diakses dari halaman website:http://epetani.deptan.go.id/budidaya/mina-padi-kolam-dalam-8111. Pada tanggal Selasa, 24 Desember 2013. Makassar.

Kementerian Kelautan dan Perikanan, 2011. “Teknik Dudidaya Minapadi”. Badan Pengembangan SDM KP pusat Penyuluhan Kelautan dan Perikanan.

PERANAN CENDAWAN ENDOFIT TERHADAP KESEHATAN TANAMAN

-          Cendawan endofit dapat melindungi tanaman inang dari serangan patogen dengan senyawa yang dikeluarkannya, berupa senyawa metabolit sekunder yang merupakan senyawa bioaktif dan dapat berfungsi untuk membunuh pathogen.

-          Kolonisasi cendawan endofit dapat meningkatkan senyawa fenol dalam inang, Senyawa fenol dapat menghambat patogen secara langsung atau dengan produk oksidasinya dan juga dengan meningkatkan perubahan metabolik kompleks seperti senyawa yang dapat membentuk barrier pertahanan.

-          Penggunaan cendawan endofit dari kelas Actinomycetes sebagai agen pengendali hayati mempunyai keuntungan yaitu kemampuannya untuk menghindari persaingan dengan sebagian besar mikroorganisme tanah dan rhizosfer karena cendawan dari kelas Actinomycetes ini hidup di dalam jaringan akar tanaman .

-          Mekanisme penghambatan cendawan endofit terhadap patogen dapat secara langsung dengan mekanisme antagonis dan secara tidak langsung dengan mekanisme ketahanan terinduksi. Perlindungan tanaman dengan ketahanan terinduksi didasarkan pada rangsangan mekanisme ketahanan oleh adanya perubahan metabolik yang memungkinkan tanaman untuk lebih mengefektifkan ketahanannya. Diperkirakan ketahanan terinduksi dapat berkembang apabila sel-sel tanaman mampu menghasilkan enzim-enzim baru yang mengaktifkan gen tanaman yang bertanggung jawab dalam mekanisme ketahanan tanaman tersebut.

PARACOCCUS DENITRIFICANS

1. Karakteristik Morfologi Paracoccus denitrificans

Gambar 1: Bentuk Morfologi bakteri Paracoccus denitrificans

Paracoccus denitrificans adalah bakteri gram negatif berbentuk coccus.  Paracoccus denitrificans tinggal di dalam tanah baik lingkungan aerobik atau anaerobik. Mereka juga memiliki kemampuan untuk hidup dalam berbagai macam media termasuk C1 dan sulfur. Mereka bisa menggunakan sumber organik energi, seperti metanol atau metilamin, atau bertindak sebagai chemolithotrophs, menggunakan sumber energi anorganik dengan karbon dioksida sebagai sumber karbon mereka. denitrificans Paracoccus pertama kali mengisolasi pada tahun 1910 oleh Martinus Beijerinck, seorang ahli mikrobiologi Belanda, dan diberi nama Micrococcus denitrificans . Pada tahun 1969, DH Davis mengubah nama bakteri untuk nama yang sekarang karena penemuan bahwa bakteri yang terdapat banyak fitur diketahui berada di mitokondria. Ada kemungkinan bahwa Paracoccus denitrificans merupakan nenek moyang mitokondria eukariotik (Copeland at al,2007).

2.Karakteristik Fisiologi Paracoccus denitrificans

Genom Paracoccus denitrificans terdiri dari dua kromosom melingkar dan satu plasmid. Kromosom pertama memiliki 2.852.282 pasangan basa. Kromosom kedua memiliki 1.730.097 pasangan basa dan plasmid memiliki 653.815 pasangan basa. Plasmid mengkodekan protein 611 terkenal seperti deformilase Formyltetrahydrofolate dan TonB tergantung siderophore reseptor prekursor. Protein ini tidak penting untuk kelangsungan hidup bakteri, namun protein ditranskripsi dan diterjemahkan dari plasmid memungkinkan bakteri untuk melakukan banyak fungsi metabolik. Ini adalah apa yang memberi Paracoccus denitrificans fitur yang unik, seperti kemampuan untuk memetabolisme amonium menjadi gas nitrogen (Reinman at al,2007).

Paracoccus denitrificans hidup terutama dalam tanah. Mereka memproduksi oksida nitrat dan asam nitrat, yang menimbulkan kerusakan atmosfer. Mereka juga bertanggung jawab atas hilangnya pupuk nitrogen dalam tanah pertanian. Mereka melakukannya dengan seorang diri mengubah nitrat menjadi gas nitrogen.

Sel struktur Paracoccus denitrificans mirip dengan itu dalam mitokondria eukariotik. Ini adalah bakteri gram negatif dan karenanya memiliki semua sifat-sifat khas dari bakteri gram negatif. Ini termasuk membran ganda dengan dinding sel. Selama fase pertumbuhan eksponensial, hal ini terutama berbentuk batang, namun, sel-sel hampir bulat diamati ketika dalam fase diam. Mereka dapat memperoleh energi dari keduanya, seperti metanol dan metilamin, dan anorganik senyawa organik, seperti hidrogen dan sulfur. Sebuah fitur bakteri ini adalah kemampuannya untuk sendirian mengkonversi nitrat untuk dinitrogen dalam proses yang disebut denitrifikasi.

3. Karakteristik Biokimia Paracoccus denitrificans

Paracoccus adalah Genus biokimia serbaguna, dengan berbagai kemampuan degradatif beragam dan aplikasi potensial dalam bioremediasi. Strain telah diisolasi yang memanfaatkan tiosianat sebagai sumber energi, untuk kemungkinan bioremediasi limbah tiosianat terkontaminasi dari pabrik coke oven. Strain yang mendegradasi halobenzoates dalam kondisi denitrifikasi anaerobik, dan sulfonat menurunkan termasuk cysteate, taurin, 2-hydroxyethanesulfonate, sulfoacetate dan 3-aminopropanesulfonate dalam kondisi pertumbuhan anaerobik telah dijelaskan. Beberapa strain P. denitrificans telah diisolasi yang tumbuh chemolithoautotrophically menggunakan karbon disulfida atau karbonil sulfida sebagai sumber energi, dan strain telah diisolasi dari lumpur aktif yang mampu senyawa karbon kuaterner merendahkan seperti dimethylmalonate dalam kondisi denitrifikasi. Strain lain diisolasi dari lumpur aktif merusak berbagai amina alkohol di bawah kedua kondisi aerobik dan anaerobik. Beberapa strain mampu 'denitrifikasi aerobik', yang disimilasi lengkap nitrat ke dinitrogen (atau nitrous oksida) di bawah kondisi pertumbuhan aerobik. P. denitrificans juga memiliki kemampuan yang sangat tidak biasa untuk mengoksidasi amonia menjadi nitrit selama pertumbuhan pada sumber energi organik ('heterotrofik nitrifikasi'). Digabungkan ke denitrifikasi, nitrifikasi heterotrofik memungkinkan untuk transformasi lengkap amonia ke dinitrogen oleh organisme tunggal. Ketersediaan urutan genom dan selanjutnya kerja tindak lanjut akan kembali menyoroti kemampuan metabolisme beragam dan tidak biasa (Baker dkk, 1998).

4. Karakteristik Molekuler Paracoccus denitrificans

Menurut Timkovich and Dickerson (1976) dalam Anonim (2012), bakteri Paracoccus denitrificans secara molekuler memiliki struktur protein yang berbentuk struktur tersier. Struktur tersier dari suatu protein adalah lapisan yang tumpang tindih di atas pola struktur sekunder yang terdiri atas pemutarbalikan tak beraturan dari ikatan antara rantai samping (gugus R) berbagai asam amino (Gambar 10). Struktur ini merupakan konformasi tiga dimensi yang mengacu pada hubungan spasial antar struktur sekunder. Struktur ini distabilkan oleh empat macam ikatan, yakni ikatan hidrogen, ikatan ionik, ikatan kovalen, dan ikatan hidrofobik. Dalam struktur ini, ikatan hidrofobik sangat penting bagi protein. Asam amino yang memiliki sifat hidrofobik akan berikatan di bagian dalam protein globuler yang tidak berikatan dengan air, sementara asam amino yang bersifat hodrofilik secara umum akan berada di sisi permukaan luar yang berikatan dengan air di sekelilingnya.

Gambar 2: Bentuk struktur tersier dari protein denitrificans cytochrome C550 pada bakteri Paracoccus denitrificans (Timkovich and Dickerson, 1976).